Ο Χριστόφορος Μουτάφης απέκτησε το πτυχίο Φυσικής από το Πανεπιστήμιο Κρήτης το 2003 και το διδακτορικό του δίπλωμα στην Φυσική από το University of Cambridge (ΗΒ) το 2009. Το ακαδημαϊκό γενεαλογικό του δένδρο είναι εδώ.
Διετέλεσε επίκουρος καθηγητής στο Πανεπιστήμιο του Μάντσεστερ (2015-2024) και εν συνεχεία αναπληρωτής καθηγητής στο Πανεπιστήμιο του Μάντσεστερ (από το 2024). Διετέλεσε senior fellow (04/2025-06/2025) στο Collegium Helveticum το Ινστιτούτο Ανώτατων σπουδών της Ελβετίας και στο Ινστιτούτο Νευροπληροφορικής (ΙΝΙ, ETHZ & UZH). Το 2025 ήλθε στο Τμήμα Φυσικής του Πανεπιστημίου Κρήτης ως Αναπληρωτής Καθηγητής. Εργάστηκε ως μεταδιδακτορικός (2011-2015) στο Swiss Light Source, Paul Scherrer Institute (CH), στο Institute of Condensed Matter Physics, ÉPFL (2010-2011) (CH), καθώς και στο Τμήμα Φυσικής του Πανεπιστημίου της Κονστάνζης (DE) (2009-2010). Υπήρξε επισκέπτης ερευνητής στο Institute for Materials Research, Tohoku University, Japan (04–07/2008), ως υπότροφος του Japanese Society for the Promotion of Science (JSPS).
Φυσική για Νευρομορφικούς Υπολογιστές, Μαγνητισμός, Τοπολογία, Μαγνητικά Σκυρμιόνια, Spintronics, Απεικόνιση με ακτίνες Χ ακτινοβολίας σύγχροτρον, Νευρωνικά Δίκτυα, Τεχνητή & Νευρομορφική Νοημοσύνη.
